आयसोफ्लाव्होनॉइड्सची आण्विक रचना स्टिरॉइडल इस्ट्रोजेन (महिला लैंगिक संप्रेरक) सारखी असते आणि म्हणून त्यांना म्हणतात. फायटोएस्ट्रोजेन. तथापि, त्यांची संप्रेरक क्रिया सस्तन प्राण्यांमध्ये तयार होणाऱ्या इस्ट्रोजेनच्या तुलनेत 100 ते 1,000 च्या घटकाने कमी असते. त्यांच्या रासायनिक-संरचनात्मक समानतेमुळे मादी लिंग हार्मोन्स, isoflavones अन्नासोबत खाल्ल्याने तथाकथित प्रकार 2 इस्ट्रोजेन रिसेप्टरला बांधता येते आणि अंतर्जात इस्ट्रोजेनसाठी ते ब्लॉक होते. त्यानुसार, isoflavones रजोनिवृत्तीनंतरच्या स्त्रियांमध्ये कमी अंतर्जात इस्ट्रोजेन पातळी अधिक इस्ट्रोजेनिक प्रभाव दाखवतात, तर रजोनिवृत्तीपूर्व स्त्रियांमध्ये आयसोफ्लाव्होनचा इस्ट्रोजेन रिसेप्टर्स अवरोधित करून अँटीस्ट्रोजेनिक प्रभाव असतो.
